自動返信メールが送信されない場合には下記が考えられます。

●GMOイプシロンにて正常に決済が完了している場合
　購入者が注文を完了した際に、自動返信メールの注文確認メールが「送付しない」になっていた。
　カード情報入力画面にて入力をしている最中にメイン画面を閉じてしまった。
　推奨環境以外の環境で注文を完了した。

●GMOイプシロンにて正常に決済が完了していない場合
　セキュリティソフト等が原因で、注文完了時にデータ送信が正常に完了しなかった。
　推奨環境以外の環境で注文を完了した。
　カード情報の入力画面を表示する前にメイン画面を終了してしまった。
　カード情報の入力画面にてキャンセルをした。

以上が考えられます。

正しく決済が完了するまで、ショップの画面を開いておいていただく必要がございます。
決済が終了する前に、メイン画面を注文者様が閉じてしまった場合、自動返信メールが
送信されません。
クレジット決済でのご注文があった場合には、管理画面とGMOイプシロンの管理画面の両方を
ご確認いただき、GMOイプシロンの管理画面でのステータスを正としてご対応くださいますよう
お願い申し上げます。