SSLサーバー証明書は1コモンネームにつき1契約必要になります。またコモンネームごととなりますため、ドメインごとでもそれぞれ契約は必要となります。
また、同一コモンネームの場合は、1つのSSLサーバー証明書をお申込みいただければ複数のサーバーで運用が可能となります。
同時に稼動するサーバー台数分の契約は不要です。
ただし、複数のコモンネームを複数のサーバーで運用する場合は、コモンネームごとの契約をお申込みください。
※ホスト名が[www.](つまりwww.○○.comというコモンネーム)で申し込みした場合のみ、www.○○.comと○○.comの2つに対してSSLサーバー証明書を利用することができます。

お申し込み方法はこちらをご参照ください。