「www.ドメイン名」配下にデータをアップロードを行うとWeb上に公開されますので、
そちらではない領域にデータをアップロードしていただければ、ブラウザでアクセス
して表示(閲覧)することはできないようになります。
※任意のディレクトリを作成することも可能です。