お名前.comのLINEとの連携は、下記手順にて解除することができます。
LINEアプリの『ホーム』にて、上部に表示されている『設定（歯車マーク）』をタップします
『アカウント』 をタップします
『連動アプリ』をタップします
連携を取り消すアプリ（お名前.com）を選択します
最下部に表示されます、『連動を解除』をタップします
「このアプリとの連動を解除しますか？」と表示されましたら、『確認』をタップします
連動アプリ一覧から「お名前.com」の表示が無くなりましたら、解除完了です。