.jpドメインの管理機関である日本レジストリサービス（JPRS）が、1年毎の登録期限更新しか受け付けていないためです。

お名前.comではお客様より複数年の契約更新を承った場合、その期間中1年毎にJPRSに対しドメインの期限更新を行いますので、Whois情報では1年分のみ延長が行われる形となります。
更新年数が誤っているということではございませんので、予めご了承下さい。なお、1年ごとの期限更新の際に、お客様から改めてお手続き頂く必要はございません。

ドメインの有効期限については管理画面より確認可能です。
方法はこちらをご覧ください。